Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hdac9Q99N13 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hdac9Q99N13 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hdac9Q99N13 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hdac9Q99N13 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hdac9Q99N13 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hdac9Q99N13 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hdac9Q99N13 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Hdac9Q99N13 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hdac9Q99N13 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hdac9Q99N13 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hdac9Q99N13 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Hdac9Q99N13 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Hdac9Q99N13 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hdac9Q99N13 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hdac9Q99N13 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Hdac9Q99N13 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Hdac9Q99N13 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hdac9Q99N13 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hdac9Q99N13 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hdac9Q99N13 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Hdac9Q99N13 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hdac9Q99N13 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hdac9Q99N13 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Hdac9Q99N13 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hdac9Q99N13 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hdac9Q99N13 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Hdac9Q99N13 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hdac9Q99N13 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hdac9Q99N13 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Hdac9Q99N13 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hdac9Q99N13 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hdac9Q99N13 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hdac9Q99N13 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hdac9Q99N13 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hdac9Q99N13 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hdac9Q99N13 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hdac9Q99N13 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hdac9Q99N13 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hdac9Q99N13 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hdac9Q99N13 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hdac9Q99N13 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
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Hdac9Q99N13 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
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