Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Gm13267-202ENSMUST00000150099 281 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 Gm33707-201ENSMUST00000195135 569 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 Gm44216-201ENSMUST00000203942 157 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 Gm42432-201ENSMUST00000197902 1617 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 Krt40-202ENSMUST00000107443 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 Gm12418-201ENSMUST00000118116 942 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 C030013C21Rik-201ENSMUST00000133400 795 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 Gm25830-201ENSMUST00000158923 132 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 Gm26272-201ENSMUST00000179241 132 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 Gm31138-201ENSMUST00000212296 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PtprtQ99M80 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Prr13-205ENSMUST00000171245 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Gm12684-201ENSMUST00000118675 999 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Gm11981-201ENSMUST00000139769 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Gm5449-201ENSMUST00000081132 357 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Ccm2-203ENSMUST00000109722 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Mrps36-203ENSMUST00000109333 701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Gm5395-201ENSMUST00000121650 915 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Mir1905-201ENSMUST00000122779 82 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Cdhr4-208ENSMUST00000176373 492 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Gm45040-201ENSMUST00000207742 578 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 AC162938.2-202ENSMUST00000215497 722 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Mrpl33-201ENSMUST00000031024 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms