Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

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Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Mir124a-1hg-201ENSMUST00000180610 4103 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Rad51c-202ENSMUST00000067692 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Dyrk1a-203ENSMUST00000122284 2356 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Gm43221-201ENSMUST00000197612 2071 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
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Hoxc12Q8K5B8 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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Hoxc12Q8K5B8 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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Hoxc12Q8K5B8 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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Hoxc12Q8K5B8 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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Hoxc12Q8K5B8 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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Hoxc12Q8K5B8 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 H2-Ob-201ENSMUST00000095342 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Olfr1415-202ENSMUST00000204009 2815 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
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