Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Ssh3Q8K330 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Ssh3Q8K330 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Ssh3Q8K330 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Ssh3Q8K330 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Ssh3Q8K330 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Ssh3Q8K330 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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