Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Snx8Q8CFD4 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Snx8Q8CFD4 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms