Protein–RNA interactions for Protein: Q80VR2

Ell3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, mousemouse

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell3Q80VR2 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Slc38a3-203ENSMUST00000177567 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Ap3b2-205ENSMUST00000152355 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
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