Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Actn1Q7TPR4 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Actn1Q7TPR4 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Actn1Q7TPR4 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Actn1Q7TPR4 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Actn1Q7TPR4 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Actn1Q7TPR4 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Actn1Q7TPR4 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Actn1Q7TPR4 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Actn1Q7TPR4 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Actn1Q7TPR4 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Actn1Q7TPR4 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Actn1Q7TPR4 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Actn1Q7TPR4 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Actn1Q7TPR4 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Actn1Q7TPR4 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Actn1Q7TPR4 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Actn1Q7TPR4 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Actn1Q7TPR4 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Actn1Q7TPR4 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Actn1Q7TPR4 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Actn1Q7TPR4 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Actn1Q7TPR4 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Actn1Q7TPR4 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Actn1Q7TPR4 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Actn1Q7TPR4 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Actn1Q7TPR4 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Actn1Q7TPR4 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Actn1Q7TPR4 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Actn1Q7TPR4 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Actn1Q7TPR4 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Actn1Q7TPR4 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Actn1Q7TPR4 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Actn1Q7TPR4 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Actn1Q7TPR4 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Actn1Q7TPR4 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Actn1Q7TPR4 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Actn1Q7TPR4 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Actn1Q7TPR4 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Actn1Q7TPR4 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Actn1Q7TPR4 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Actn1Q7TPR4 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Actn1Q7TPR4 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Actn1Q7TPR4 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Actn1Q7TPR4 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Actn1Q7TPR4 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Actn1Q7TPR4 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Actn1Q7TPR4 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Actn1Q7TPR4 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms