Protein–RNA interactions for Protein: Q76I25

Higd1c, HIG1 domain family member 1C, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1cQ76I25 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms