Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rph3alQ768S4 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rph3alQ768S4 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rph3alQ768S4 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rph3alQ768S4 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rph3alQ768S4 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rph3alQ768S4 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rph3alQ768S4 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Rph3alQ768S4 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rph3alQ768S4 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rph3alQ768S4 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rph3alQ768S4 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC10□□□□□ -0.81
Rph3alQ768S4 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rph3alQ768S4 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rph3alQ768S4 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rph3alQ768S4 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rph3alQ768S4 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rph3alQ768S4 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rph3alQ768S4 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rph3alQ768S4 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rph3alQ768S4 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rph3alQ768S4 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rph3alQ768S4 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rph3alQ768S4 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rph3alQ768S4 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rph3alQ768S4 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rph3alQ768S4 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rph3alQ768S4 Kdm4a-204ENSMUST00000106406 4663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rph3alQ768S4 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rph3alQ768S4 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rph3alQ768S4 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rph3alQ768S4 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rph3alQ768S4 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Rph3alQ768S4 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rph3alQ768S4 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rph3alQ768S4 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rph3alQ768S4 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rph3alQ768S4 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rph3alQ768S4 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rph3alQ768S4 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rph3alQ768S4 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rph3alQ768S4 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Rph3alQ768S4 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rph3alQ768S4 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rph3alQ768S4 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rph3alQ768S4 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Rph3alQ768S4 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rph3alQ768S4 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rph3alQ768S4 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Rph3alQ768S4 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rph3alQ768S4 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Rph3alQ768S4 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rph3alQ768S4 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rph3alQ768S4 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rph3alQ768S4 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rph3alQ768S4 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Rph3alQ768S4 Slc45a4-207ENSMUST00000151288 7509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rph3alQ768S4 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rph3alQ768S4 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rph3alQ768S4 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rph3alQ768S4 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rph3alQ768S4 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rph3alQ768S4 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rph3alQ768S4 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rph3alQ768S4 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Rph3alQ768S4 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Rph3alQ768S4 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rph3alQ768S4 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rph3alQ768S4 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rph3alQ768S4 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rph3alQ768S4 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rph3alQ768S4 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rph3alQ768S4 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rph3alQ768S4 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rph3alQ768S4 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rph3alQ768S4 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Rph3alQ768S4 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rph3alQ768S4 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rph3alQ768S4 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rph3alQ768S4 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Rph3alQ768S4 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rph3alQ768S4 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rph3alQ768S4 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rph3alQ768S4 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rph3alQ768S4 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rph3alQ768S4 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rph3alQ768S4 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rph3alQ768S4 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rph3alQ768S4 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rph3alQ768S4 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rph3alQ768S4 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rph3alQ768S4 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rph3alQ768S4 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rph3alQ768S4 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Rph3alQ768S4 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rph3alQ768S4 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rph3alQ768S4 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Rph3alQ768S4 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rph3alQ768S4 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
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