Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Trak1Q6PD31 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms