Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Usp49Q6P9L4 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp49Q6P9L4 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp49Q6P9L4 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Usp49Q6P9L4 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp49Q6P9L4 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Usp49Q6P9L4 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Usp49Q6P9L4 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp49Q6P9L4 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp49Q6P9L4 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp49Q6P9L4 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Usp49Q6P9L4 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Usp49Q6P9L4 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Usp49Q6P9L4 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp49Q6P9L4 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp49Q6P9L4 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp49Q6P9L4 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp49Q6P9L4 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp49Q6P9L4 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp49Q6P9L4 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp49Q6P9L4 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp49Q6P9L4 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp49Q6P9L4 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp49Q6P9L4 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp49Q6P9L4 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp49Q6P9L4 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp49Q6P9L4 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp49Q6P9L4 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp49Q6P9L4 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp49Q6P9L4 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp49Q6P9L4 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp49Q6P9L4 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp49Q6P9L4 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp49Q6P9L4 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp49Q6P9L4 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp49Q6P9L4 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp49Q6P9L4 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp49Q6P9L4 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp49Q6P9L4 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp49Q6P9L4 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp49Q6P9L4 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp49Q6P9L4 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp49Q6P9L4 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp49Q6P9L4 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp49Q6P9L4 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp49Q6P9L4 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp49Q6P9L4 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp49Q6P9L4 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp49Q6P9L4 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp49Q6P9L4 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp49Q6P9L4 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp49Q6P9L4 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp49Q6P9L4 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp49Q6P9L4 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp49Q6P9L4 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp49Q6P9L4 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp49Q6P9L4 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp49Q6P9L4 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp49Q6P9L4 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp49Q6P9L4 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp49Q6P9L4 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp49Q6P9L4 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp49Q6P9L4 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp49Q6P9L4 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp49Q6P9L4 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp49Q6P9L4 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp49Q6P9L4 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp49Q6P9L4 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp49Q6P9L4 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp49Q6P9L4 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp49Q6P9L4 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp49Q6P9L4 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp49Q6P9L4 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp49Q6P9L4 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp49Q6P9L4 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp49Q6P9L4 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp49Q6P9L4 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp49Q6P9L4 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp49Q6P9L4 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp49Q6P9L4 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp49Q6P9L4 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp49Q6P9L4 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp49Q6P9L4 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp49Q6P9L4 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp49Q6P9L4 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp49Q6P9L4 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp49Q6P9L4 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp49Q6P9L4 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp49Q6P9L4 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp49Q6P9L4 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp49Q6P9L4 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp49Q6P9L4 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp49Q6P9L4 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp49Q6P9L4 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp49Q6P9L4 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp49Q6P9L4 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp49Q6P9L4 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp49Q6P9L4 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp49Q6P9L4 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp49Q6P9L4 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms