Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Krt40Q6IFX3 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
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Krt40Q6IFX3 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Krt40Q6IFX3 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Krt40Q6IFX3 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Krt40Q6IFX3 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Krt40Q6IFX3 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Krt40Q6IFX3 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krt40Q6IFX3 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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