Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Top2bQ64511 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Top2bQ64511 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Top2bQ64511 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Top2bQ64511 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Top2bQ64511 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Top2bQ64511 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Top2bQ64511 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Top2bQ64511 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Top2bQ64511 Mir181d-201ENSMUST00000102383 72 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Top2bQ64511 Gm11979-201ENSMUST00000119629 743 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Top2bQ64511 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Top2bQ64511 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Top2bQ64511 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Top2bQ64511 AC153962.2-201ENSMUST00000219417 550 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Top2bQ64511 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Top2bQ64511 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Top2bQ64511 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Top2bQ64511 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Top2bQ64511 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Top2bQ64511 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Top2bQ64511 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Top2bQ64511 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Top2bQ64511 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Top2bQ64511 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Top2bQ64511 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Top2bQ64511 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Top2bQ64511 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Top2bQ64511 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Top2bQ64511 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Top2bQ64511 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Top2bQ64511 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Top2bQ64511 AC034099.1-202ENSMUST00000133843 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Top2bQ64511 Gm13965-201ENSMUST00000154834 576 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Top2bQ64511 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Top2bQ64511 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Top2bQ64511 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Top2bQ64511 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Top2bQ64511 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Top2bQ64511 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Top2bQ64511 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Top2bQ64511 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Top2bQ64511 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Top2bQ64511 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Top2bQ64511 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Top2bQ64511 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Top2bQ64511 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Top2bQ64511 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Top2bQ64511 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Top2bQ64511 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Top2bQ64511 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Top2bQ64511 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Top2bQ64511 Gm5340-201ENSMUST00000203733 880 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Top2bQ64511 Gm45500-201ENSMUST00000211676 803 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Top2bQ64511 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Top2bQ64511 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Top2bQ64511 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Top2bQ64511 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Top2bQ64511 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Top2bQ64511 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Top2bQ64511 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Top2bQ64511 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Top2bQ64511 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Top2bQ64511 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Top2bQ64511 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Top2bQ64511 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Top2bQ64511 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Top2bQ64511 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Top2bQ64511 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Top2bQ64511 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Top2bQ64511 1700001C02Rik-202ENSMUST00000114743 729 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Top2bQ64511 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Top2bQ64511 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Top2bQ64511 Gm34655-202ENSMUST00000215259 877 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Top2bQ64511 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Top2bQ64511 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Top2bQ64511 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Top2bQ64511 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Top2bQ64511 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Top2bQ64511 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Top2bQ64511 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Top2bQ64511 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Top2bQ64511 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Top2bQ64511 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Top2bQ64511 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Top2bQ64511 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Top2bQ64511 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Top2bQ64511 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Top2bQ64511 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Top2bQ64511 Gm5909-201ENSMUST00000119768 1281 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Top2bQ64511 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Top2bQ64511 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Top2bQ64511 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Top2bQ64511 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Top2bQ64511 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Top2bQ64511 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Top2bQ64511 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Top2bQ64511 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Top2bQ64511 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Top2bQ64511 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms