Protein–RNA interactions for Protein: Q64127

Trim24, Transcription intermediary factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim24Q64127 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trim24Q64127 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trim24Q64127 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trim24Q64127 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trim24Q64127 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trim24Q64127 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Trim24Q64127 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Trim24Q64127 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trim24Q64127 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Trim24Q64127 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Trim24Q64127 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trim24Q64127 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trim24Q64127 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trim24Q64127 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trim24Q64127 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Trim24Q64127 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trim24Q64127 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trim24Q64127 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trim24Q64127 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trim24Q64127 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trim24Q64127 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trim24Q64127 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trim24Q64127 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Trim24Q64127 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trim24Q64127 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trim24Q64127 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trim24Q64127 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trim24Q64127 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Trim24Q64127 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trim24Q64127 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trim24Q64127 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trim24Q64127 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trim24Q64127 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trim24Q64127 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Trim24Q64127 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trim24Q64127 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trim24Q64127 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trim24Q64127 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trim24Q64127 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trim24Q64127 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trim24Q64127 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trim24Q64127 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trim24Q64127 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trim24Q64127 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trim24Q64127 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trim24Q64127 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trim24Q64127 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trim24Q64127 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trim24Q64127 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trim24Q64127 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trim24Q64127 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Trim24Q64127 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Trim24Q64127 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trim24Q64127 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trim24Q64127 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trim24Q64127 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trim24Q64127 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trim24Q64127 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Trim24Q64127 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Trim24Q64127 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Trim24Q64127 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trim24Q64127 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trim24Q64127 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trim24Q64127 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trim24Q64127 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trim24Q64127 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trim24Q64127 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trim24Q64127 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trim24Q64127 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trim24Q64127 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trim24Q64127 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trim24Q64127 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trim24Q64127 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trim24Q64127 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trim24Q64127 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trim24Q64127 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trim24Q64127 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trim24Q64127 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trim24Q64127 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trim24Q64127 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trim24Q64127 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trim24Q64127 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trim24Q64127 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trim24Q64127 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Trim24Q64127 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trim24Q64127 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Trim24Q64127 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trim24Q64127 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trim24Q64127 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trim24Q64127 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trim24Q64127 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trim24Q64127 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trim24Q64127 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trim24Q64127 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trim24Q64127 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trim24Q64127 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trim24Q64127 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trim24Q64127 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trim24Q64127 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trim24Q64127 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.6 ms