Protein–RNA interactions for Protein: Q63871

Polr2k, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, mousemouse

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2kQ63871 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Polr2kQ63871 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms