Protein–RNA interactions for Protein: Q62066

Phox2a, Paired mesoderm homeobox protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2aQ62066 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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