Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms