Protein–RNA interactions for Protein: Q60949

Tbc1d1, TBC1 domain family member 1, mousemouse

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Length 1,255 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d1Q60949 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tbc1d1Q60949 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tbc1d1Q60949 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tbc1d1Q60949 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tbc1d1Q60949 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tbc1d1Q60949 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tbc1d1Q60949 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tbc1d1Q60949 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tbc1d1Q60949 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tbc1d1Q60949 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tbc1d1Q60949 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tbc1d1Q60949 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tbc1d1Q60949 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Tbc1d1Q60949 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Tbc1d1Q60949 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tbc1d1Q60949 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Tbc1d1Q60949 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Tbc1d1Q60949 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tbc1d1Q60949 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tbc1d1Q60949 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Tbc1d1Q60949 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Tbc1d1Q60949 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
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Tbc1d1Q60949 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tbc1d1Q60949 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tbc1d1Q60949 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tbc1d1Q60949 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tbc1d1Q60949 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tbc1d1Q60949 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tbc1d1Q60949 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tbc1d1Q60949 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Tbc1d1Q60949 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Tbc1d1Q60949 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tbc1d1Q60949 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tbc1d1Q60949 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tbc1d1Q60949 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tbc1d1Q60949 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tbc1d1Q60949 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tbc1d1Q60949 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Tbc1d1Q60949 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tbc1d1Q60949 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tbc1d1Q60949 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tbc1d1Q60949 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Tbc1d1Q60949 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tbc1d1Q60949 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Tbc1d1Q60949 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Tbc1d1Q60949 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Tbc1d1Q60949 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
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Tbc1d1Q60949 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tbc1d1Q60949 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tbc1d1Q60949 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tbc1d1Q60949 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tbc1d1Q60949 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tbc1d1Q60949 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tbc1d1Q60949 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tbc1d1Q60949 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tbc1d1Q60949 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tbc1d1Q60949 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tbc1d1Q60949 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tbc1d1Q60949 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tbc1d1Q60949 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tbc1d1Q60949 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tbc1d1Q60949 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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