Protein–RNA interactions for Protein: Q5RIS0

Gm11487, Novel protein, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11487Q5RIS0 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm11487Q5RIS0 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm11487Q5RIS0 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm11487Q5RIS0 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm11487Q5RIS0 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm11487Q5RIS0 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm11487Q5RIS0 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm11487Q5RIS0 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm11487Q5RIS0 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm11487Q5RIS0 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm11487Q5RIS0 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm11487Q5RIS0 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm11487Q5RIS0 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm11487Q5RIS0 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm11487Q5RIS0 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm11487Q5RIS0 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm11487Q5RIS0 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm11487Q5RIS0 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm11487Q5RIS0 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm11487Q5RIS0 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm11487Q5RIS0 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm11487Q5RIS0 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm11487Q5RIS0 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm11487Q5RIS0 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm11487Q5RIS0 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm11487Q5RIS0 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm11487Q5RIS0 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm11487Q5RIS0 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm11487Q5RIS0 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm11487Q5RIS0 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm11487Q5RIS0 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm11487Q5RIS0 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm11487Q5RIS0 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm11487Q5RIS0 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm11487Q5RIS0 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm11487Q5RIS0 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm11487Q5RIS0 Gemin6-201ENSMUST00000069486 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm11487Q5RIS0 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm11487Q5RIS0 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm11487Q5RIS0 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm11487Q5RIS0 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm11487Q5RIS0 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm11487Q5RIS0 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm11487Q5RIS0 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm11487Q5RIS0 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm11487Q5RIS0 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm11487Q5RIS0 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm11487Q5RIS0 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm11487Q5RIS0 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm11487Q5RIS0 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm11487Q5RIS0 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm11487Q5RIS0 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm11487Q5RIS0 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm11487Q5RIS0 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm11487Q5RIS0 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm11487Q5RIS0 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm11487Q5RIS0 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm11487Q5RIS0 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm11487Q5RIS0 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm11487Q5RIS0 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm11487Q5RIS0 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm11487Q5RIS0 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm11487Q5RIS0 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm11487Q5RIS0 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm11487Q5RIS0 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm11487Q5RIS0 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm11487Q5RIS0 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm11487Q5RIS0 Tbata-210ENSMUST00000151886 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm11487Q5RIS0 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm11487Q5RIS0 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm11487Q5RIS0 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm11487Q5RIS0 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm11487Q5RIS0 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm11487Q5RIS0 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm11487Q5RIS0 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm11487Q5RIS0 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm11487Q5RIS0 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm11487Q5RIS0 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm11487Q5RIS0 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm11487Q5RIS0 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm11487Q5RIS0 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm11487Q5RIS0 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm11487Q5RIS0 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm11487Q5RIS0 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm11487Q5RIS0 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm11487Q5RIS0 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm11487Q5RIS0 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm11487Q5RIS0 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm11487Q5RIS0 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm11487Q5RIS0 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm11487Q5RIS0 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm11487Q5RIS0 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm11487Q5RIS0 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm11487Q5RIS0 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm11487Q5RIS0 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm11487Q5RIS0 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm11487Q5RIS0 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm11487Q5RIS0 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm11487Q5RIS0 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm11487Q5RIS0 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.5 ms