Protein–RNA interactions for Protein: Q56A08

Gpkow, G-patch domain and KOW motifs-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpkowQ56A08 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GpkowQ56A08 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GpkowQ56A08 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GpkowQ56A08 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GpkowQ56A08 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GpkowQ56A08 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GpkowQ56A08 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GpkowQ56A08 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GpkowQ56A08 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GpkowQ56A08 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GpkowQ56A08 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GpkowQ56A08 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GpkowQ56A08 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GpkowQ56A08 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GpkowQ56A08 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GpkowQ56A08 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GpkowQ56A08 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GpkowQ56A08 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GpkowQ56A08 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GpkowQ56A08 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GpkowQ56A08 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GpkowQ56A08 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GpkowQ56A08 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GpkowQ56A08 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GpkowQ56A08 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GpkowQ56A08 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GpkowQ56A08 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GpkowQ56A08 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GpkowQ56A08 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GpkowQ56A08 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GpkowQ56A08 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GpkowQ56A08 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GpkowQ56A08 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GpkowQ56A08 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GpkowQ56A08 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GpkowQ56A08 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GpkowQ56A08 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GpkowQ56A08 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GpkowQ56A08 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GpkowQ56A08 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GpkowQ56A08 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GpkowQ56A08 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GpkowQ56A08 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GpkowQ56A08 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GpkowQ56A08 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GpkowQ56A08 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GpkowQ56A08 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GpkowQ56A08 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GpkowQ56A08 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GpkowQ56A08 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GpkowQ56A08 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GpkowQ56A08 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GpkowQ56A08 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GpkowQ56A08 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GpkowQ56A08 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GpkowQ56A08 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GpkowQ56A08 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GpkowQ56A08 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GpkowQ56A08 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GpkowQ56A08 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GpkowQ56A08 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GpkowQ56A08 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GpkowQ56A08 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GpkowQ56A08 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GpkowQ56A08 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GpkowQ56A08 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GpkowQ56A08 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GpkowQ56A08 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GpkowQ56A08 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GpkowQ56A08 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GpkowQ56A08 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GpkowQ56A08 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GpkowQ56A08 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GpkowQ56A08 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GpkowQ56A08 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GpkowQ56A08 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GpkowQ56A08 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GpkowQ56A08 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GpkowQ56A08 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GpkowQ56A08 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GpkowQ56A08 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GpkowQ56A08 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GpkowQ56A08 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GpkowQ56A08 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GpkowQ56A08 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GpkowQ56A08 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GpkowQ56A08 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GpkowQ56A08 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GpkowQ56A08 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GpkowQ56A08 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GpkowQ56A08 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GpkowQ56A08 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GpkowQ56A08 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GpkowQ56A08 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GpkowQ56A08 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GpkowQ56A08 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GpkowQ56A08 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GpkowQ56A08 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GpkowQ56A08 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GpkowQ56A08 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 279 ms