Protein–RNA interactions for Protein: Q4QQM4

Trp53i11, Tumor protein p53-inducible protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53i11Q4QQM4 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trp53i11Q4QQM4 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
Trp53i11Q4QQM4 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Trp53i11Q4QQM4 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trp53i11Q4QQM4 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trp53i11Q4QQM4 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trp53i11Q4QQM4 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trp53i11Q4QQM4 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trp53i11Q4QQM4 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trp53i11Q4QQM4 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trp53i11Q4QQM4 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trp53i11Q4QQM4 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trp53i11Q4QQM4 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trp53i11Q4QQM4 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trp53i11Q4QQM4 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trp53i11Q4QQM4 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trp53i11Q4QQM4 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trp53i11Q4QQM4 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trp53i11Q4QQM4 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trp53i11Q4QQM4 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trp53i11Q4QQM4 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Trp53i11Q4QQM4 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trp53i11Q4QQM4 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trp53i11Q4QQM4 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trp53i11Q4QQM4 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trp53i11Q4QQM4 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trp53i11Q4QQM4 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Trp53i11Q4QQM4 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trp53i11Q4QQM4 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trp53i11Q4QQM4 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Trp53i11Q4QQM4 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Trp53i11Q4QQM4 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trp53i11Q4QQM4 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Trp53i11Q4QQM4 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trp53i11Q4QQM4 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trp53i11Q4QQM4 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Trp53i11Q4QQM4 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Trp53i11Q4QQM4 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Trp53i11Q4QQM4 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trp53i11Q4QQM4 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Trp53i11Q4QQM4 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Trp53i11Q4QQM4 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trp53i11Q4QQM4 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trp53i11Q4QQM4 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trp53i11Q4QQM4 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trp53i11Q4QQM4 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trp53i11Q4QQM4 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trp53i11Q4QQM4 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trp53i11Q4QQM4 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trp53i11Q4QQM4 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trp53i11Q4QQM4 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trp53i11Q4QQM4 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trp53i11Q4QQM4 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trp53i11Q4QQM4 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trp53i11Q4QQM4 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trp53i11Q4QQM4 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trp53i11Q4QQM4 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trp53i11Q4QQM4 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trp53i11Q4QQM4 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trp53i11Q4QQM4 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trp53i11Q4QQM4 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trp53i11Q4QQM4 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trp53i11Q4QQM4 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trp53i11Q4QQM4 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trp53i11Q4QQM4 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trp53i11Q4QQM4 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trp53i11Q4QQM4 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trp53i11Q4QQM4 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trp53i11Q4QQM4 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trp53i11Q4QQM4 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trp53i11Q4QQM4 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Trp53i11Q4QQM4 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Trp53i11Q4QQM4 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trp53i11Q4QQM4 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trp53i11Q4QQM4 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trp53i11Q4QQM4 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trp53i11Q4QQM4 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trp53i11Q4QQM4 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trp53i11Q4QQM4 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Trp53i11Q4QQM4 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trp53i11Q4QQM4 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms