Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp19Q3UJD6 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Usp19Q3UJD6 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp19Q3UJD6 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp19Q3UJD6 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp19Q3UJD6 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Usp19Q3UJD6 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp19Q3UJD6 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp19Q3UJD6 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Usp19Q3UJD6 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp19Q3UJD6 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Usp19Q3UJD6 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Usp19Q3UJD6 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Usp19Q3UJD6 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Usp19Q3UJD6 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Usp19Q3UJD6 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Usp19Q3UJD6 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Usp19Q3UJD6 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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