Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms