Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Rnf149Q3U2C5 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms