Protein–RNA interactions for Protein: Q3TDV8

Zfp444, Zinc finger protein 444, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp444Q3TDV8 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfp444Q3TDV8 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfp444Q3TDV8 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfp444Q3TDV8 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Zfp444Q3TDV8 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Zfp444Q3TDV8 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Zfp444Q3TDV8 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Zfp444Q3TDV8 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp444Q3TDV8 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp444Q3TDV8 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp444Q3TDV8 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp444Q3TDV8 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp444Q3TDV8 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp444Q3TDV8 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp444Q3TDV8 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp444Q3TDV8 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp444Q3TDV8 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp444Q3TDV8 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp444Q3TDV8 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp444Q3TDV8 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp444Q3TDV8 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp444Q3TDV8 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp444Q3TDV8 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp444Q3TDV8 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp444Q3TDV8 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp444Q3TDV8 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp444Q3TDV8 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp444Q3TDV8 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp444Q3TDV8 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp444Q3TDV8 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp444Q3TDV8 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp444Q3TDV8 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp444Q3TDV8 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp444Q3TDV8 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp444Q3TDV8 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp444Q3TDV8 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp444Q3TDV8 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp444Q3TDV8 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp444Q3TDV8 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp444Q3TDV8 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp444Q3TDV8 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp444Q3TDV8 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp444Q3TDV8 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp444Q3TDV8 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp444Q3TDV8 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp444Q3TDV8 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp444Q3TDV8 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp444Q3TDV8 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp444Q3TDV8 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp444Q3TDV8 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp444Q3TDV8 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp444Q3TDV8 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp444Q3TDV8 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp444Q3TDV8 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp444Q3TDV8 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp444Q3TDV8 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp444Q3TDV8 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp444Q3TDV8 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp444Q3TDV8 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp444Q3TDV8 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp444Q3TDV8 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp444Q3TDV8 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp444Q3TDV8 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp444Q3TDV8 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp444Q3TDV8 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp444Q3TDV8 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp444Q3TDV8 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp444Q3TDV8 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp444Q3TDV8 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp444Q3TDV8 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp444Q3TDV8 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp444Q3TDV8 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp444Q3TDV8 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp444Q3TDV8 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp444Q3TDV8 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp444Q3TDV8 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp444Q3TDV8 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp444Q3TDV8 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp444Q3TDV8 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp444Q3TDV8 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp444Q3TDV8 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp444Q3TDV8 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp444Q3TDV8 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp444Q3TDV8 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp444Q3TDV8 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp444Q3TDV8 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp444Q3TDV8 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp444Q3TDV8 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp444Q3TDV8 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp444Q3TDV8 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp444Q3TDV8 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp444Q3TDV8 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp444Q3TDV8 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp444Q3TDV8 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp444Q3TDV8 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp444Q3TDV8 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp444Q3TDV8 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp444Q3TDV8 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp444Q3TDV8 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp444Q3TDV8 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms