Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rundc1Q0VDN7 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms