Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
MestQ07646 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
MestQ07646 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
MestQ07646 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
MestQ07646 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
MestQ07646 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
MestQ07646 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
MestQ07646 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
MestQ07646 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
MestQ07646 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
MestQ07646 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
MestQ07646 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
MestQ07646 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
MestQ07646 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
MestQ07646 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
MestQ07646 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
MestQ07646 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
MestQ07646 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
MestQ07646 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
MestQ07646 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
MestQ07646 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
MestQ07646 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
MestQ07646 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
MestQ07646 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
MestQ07646 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
MestQ07646 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
MestQ07646 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
MestQ07646 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
MestQ07646 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
MestQ07646 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
MestQ07646 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
MestQ07646 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
MestQ07646 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
MestQ07646 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
MestQ07646 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
MestQ07646 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
MestQ07646 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
MestQ07646 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
MestQ07646 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
MestQ07646 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
MestQ07646 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
MestQ07646 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
MestQ07646 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
MestQ07646 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
MestQ07646 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
MestQ07646 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
MestQ07646 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
MestQ07646 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
MestQ07646 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
MestQ07646 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
MestQ07646 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
MestQ07646 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
MestQ07646 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
MestQ07646 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
MestQ07646 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
MestQ07646 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
MestQ07646 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
MestQ07646 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
MestQ07646 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
MestQ07646 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
MestQ07646 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
MestQ07646 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
MestQ07646 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
MestQ07646 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
MestQ07646 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
MestQ07646 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
MestQ07646 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
MestQ07646 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
MestQ07646 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
MestQ07646 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
MestQ07646 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
MestQ07646 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
MestQ07646 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
MestQ07646 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
MestQ07646 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
MestQ07646 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
MestQ07646 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
MestQ07646 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
MestQ07646 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
MestQ07646 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
MestQ07646 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
MestQ07646 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
MestQ07646 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
MestQ07646 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
MestQ07646 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
MestQ07646 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
MestQ07646 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
MestQ07646 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
MestQ07646 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
MestQ07646 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
MestQ07646 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
MestQ07646 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
MestQ07646 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
MestQ07646 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
MestQ07646 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
MestQ07646 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
MestQ07646 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
MestQ07646 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
MestQ07646 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
MestQ07646 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms