Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Mc1rQ01727 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms