Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pkp1P97350 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pkp1P97350 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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