Protein–RNA interactions for Protein: P82198

Tgfbi, Transforming growth factor-beta-induced protein ig-h3, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfbiP82198 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TgfbiP82198 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
TgfbiP82198 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TgfbiP82198 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TgfbiP82198 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TgfbiP82198 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TgfbiP82198 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TgfbiP82198 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TgfbiP82198 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TgfbiP82198 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TgfbiP82198 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TgfbiP82198 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TgfbiP82198 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TgfbiP82198 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TgfbiP82198 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TgfbiP82198 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TgfbiP82198 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TgfbiP82198 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TgfbiP82198 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TgfbiP82198 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TgfbiP82198 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TgfbiP82198 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TgfbiP82198 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TgfbiP82198 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TgfbiP82198 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TgfbiP82198 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
TgfbiP82198 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TgfbiP82198 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TgfbiP82198 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TgfbiP82198 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TgfbiP82198 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TgfbiP82198 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TgfbiP82198 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TgfbiP82198 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TgfbiP82198 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TgfbiP82198 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TgfbiP82198 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TgfbiP82198 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TgfbiP82198 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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TgfbiP82198 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
TgfbiP82198 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
TgfbiP82198 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TgfbiP82198 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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TgfbiP82198 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TgfbiP82198 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TgfbiP82198 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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TgfbiP82198 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TgfbiP82198 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TgfbiP82198 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TgfbiP82198 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TgfbiP82198 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TgfbiP82198 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TgfbiP82198 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
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TgfbiP82198 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TgfbiP82198 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TgfbiP82198 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TgfbiP82198 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TgfbiP82198 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TgfbiP82198 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TgfbiP82198 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TgfbiP82198 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TgfbiP82198 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TgfbiP82198 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TgfbiP82198 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TgfbiP82198 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TgfbiP82198 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TgfbiP82198 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TgfbiP82198 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TgfbiP82198 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TgfbiP82198 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TgfbiP82198 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TgfbiP82198 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TgfbiP82198 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TgfbiP82198 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TgfbiP82198 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TgfbiP82198 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
TgfbiP82198 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TgfbiP82198 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
TgfbiP82198 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TgfbiP82198 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TgfbiP82198 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
TgfbiP82198 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
TgfbiP82198 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TgfbiP82198 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TgfbiP82198 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
TgfbiP82198 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TgfbiP82198 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TgfbiP82198 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
TgfbiP82198 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms