Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp46P62069 1700027A07Rik-201ENSMUST00000150472 458 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp46P62069 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp46P62069 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp46P62069 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Gm21739-202ENSMUST00000188917 933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp46P62069 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp46P62069 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp46P62069 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp46P62069 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Zmym2-202ENSMUST00000223669 1281 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp46P62069 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp46P62069 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms