Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

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Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Lmo4P61969 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Lmo4P61969 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Lmo4P61969 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Lmo4P61969 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Lmo4P61969 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Lmo4P61969 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Lmo4P61969 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Lmo4P61969 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Lmo4P61969 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Lmo4P61969 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Lmo4P61969 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Lmo4P61969 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Lmo4P61969 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Lmo4P61969 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Lmo4P61969 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
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Lmo4P61969 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
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