Protein–RNA interactions for Protein: P57784

Snrpa1, U2 small nuclear ribonucleoprotein A', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpa1P57784 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snrpa1P57784 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snrpa1P57784 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snrpa1P57784 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snrpa1P57784 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snrpa1P57784 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Snrpa1P57784 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Snrpa1P57784 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Snrpa1P57784 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Snrpa1P57784 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snrpa1P57784 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Snrpa1P57784 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snrpa1P57784 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snrpa1P57784 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snrpa1P57784 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Snrpa1P57784 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Snrpa1P57784 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Snrpa1P57784 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Snrpa1P57784 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Snrpa1P57784 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Snrpa1P57784 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Snrpa1P57784 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Snrpa1P57784 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Snrpa1P57784 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Snrpa1P57784 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Snrpa1P57784 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snrpa1P57784 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snrpa1P57784 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snrpa1P57784 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snrpa1P57784 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snrpa1P57784 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snrpa1P57784 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Snrpa1P57784 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snrpa1P57784 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snrpa1P57784 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snrpa1P57784 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snrpa1P57784 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snrpa1P57784 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Snrpa1P57784 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snrpa1P57784 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snrpa1P57784 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snrpa1P57784 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snrpa1P57784 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snrpa1P57784 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snrpa1P57784 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snrpa1P57784 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snrpa1P57784 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snrpa1P57784 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Snrpa1P57784 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snrpa1P57784 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snrpa1P57784 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snrpa1P57784 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snrpa1P57784 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snrpa1P57784 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snrpa1P57784 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snrpa1P57784 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snrpa1P57784 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snrpa1P57784 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snrpa1P57784 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snrpa1P57784 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snrpa1P57784 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Snrpa1P57784 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Snrpa1P57784 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Snrpa1P57784 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Snrpa1P57784 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Snrpa1P57784 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Snrpa1P57784 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snrpa1P57784 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Snrpa1P57784 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Snrpa1P57784 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snrpa1P57784 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Snrpa1P57784 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snrpa1P57784 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snrpa1P57784 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snrpa1P57784 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snrpa1P57784 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snrpa1P57784 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snrpa1P57784 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snrpa1P57784 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snrpa1P57784 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snrpa1P57784 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snrpa1P57784 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snrpa1P57784 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Snrpa1P57784 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snrpa1P57784 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snrpa1P57784 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snrpa1P57784 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snrpa1P57784 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snrpa1P57784 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Snrpa1P57784 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Snrpa1P57784 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Snrpa1P57784 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Snrpa1P57784 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snrpa1P57784 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snrpa1P57784 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Snrpa1P57784 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Snrpa1P57784 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Snrpa1P57784 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Snrpa1P57784 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Snrpa1P57784 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms