Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
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Cldn18P56857 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cldn18P56857 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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