Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

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Length 1,268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NcanP55066 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NcanP55066 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NcanP55066 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NcanP55066 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
NcanP55066 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
NcanP55066 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NcanP55066 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NcanP55066 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NcanP55066 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NcanP55066 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
NcanP55066 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
NcanP55066 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NcanP55066 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NcanP55066 Gm25998-201ENSMUST00000175397 53 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
NcanP55066 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NcanP55066 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NcanP55066 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
NcanP55066 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
NcanP55066 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
NcanP55066 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NcanP55066 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NcanP55066 H2-Aa-201ENSMUST00000040655 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NcanP55066 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NcanP55066 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NcanP55066 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NcanP55066 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NcanP55066 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NcanP55066 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NcanP55066 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NcanP55066 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NcanP55066 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NcanP55066 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NcanP55066 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NcanP55066 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NcanP55066 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NcanP55066 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NcanP55066 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NcanP55066 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
NcanP55066 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NcanP55066 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NcanP55066 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NcanP55066 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NcanP55066 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NcanP55066 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NcanP55066 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NcanP55066 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NcanP55066 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NcanP55066 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NcanP55066 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NcanP55066 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NcanP55066 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NcanP55066 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NcanP55066 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NcanP55066 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
NcanP55066 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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NcanP55066 Nudt12-203ENSMUST00000174122 1244 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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NcanP55066 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NcanP55066 Mpzl1-203ENSMUST00000191818 853 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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NcanP55066 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
NcanP55066 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NcanP55066 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NcanP55066 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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NcanP55066 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NcanP55066 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NcanP55066 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NcanP55066 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NcanP55066 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NcanP55066 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NcanP55066 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NcanP55066 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NcanP55066 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NcanP55066 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NcanP55066 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NcanP55066 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NcanP55066 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NcanP55066 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NcanP55066 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NcanP55066 Prr13-205ENSMUST00000171245 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NcanP55066 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
NcanP55066 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NcanP55066 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NcanP55066 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NcanP55066 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NcanP55066 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NcanP55066 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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