Protein–RNA interactions for Protein: P54728

Rad23b, UV excision repair protein RAD23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23bP54728 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 Mir181d-201ENSMUST00000102383 72 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 Znrd1-202ENSMUST00000172518 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 Gm43752-201ENSMUST00000198475 697 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 Nps-202ENSMUST00000210697 1082 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad23bP54728 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms