Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
PtpreP49446 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PtpreP49446 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Gm17917-201ENSMUST00000218561 953 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
PtpreP49446 AC079680.1-201ENSMUST00000218730 649 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PtpreP49446 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PtpreP49446 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PtpreP49446 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Gm43974-201ENSMUST00000205080 684 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtpreP49446 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
PtpreP49446 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
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PtpreP49446 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC14□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtpreP49446 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Gm45359-201ENSMUST00000210635 427 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PtpreP49446 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PtpreP49446 AC153912.1-201ENSMUST00000217011 724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtpreP49446 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PtpreP49446 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
PtpreP49446 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC14□□□□□ -0.17
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