Protein–RNA interactions for Protein: P48298

Ccl11, Eotaxin, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl11P48298 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl11P48298 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl11P48298 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl11P48298 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl11P48298 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl11P48298 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl11P48298 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl11P48298 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl11P48298 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl11P48298 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl11P48298 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl11P48298 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl11P48298 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl11P48298 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl11P48298 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl11P48298 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl11P48298 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl11P48298 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl11P48298 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl11P48298 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl11P48298 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl11P48298 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl11P48298 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl11P48298 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl11P48298 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl11P48298 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl11P48298 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl11P48298 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl11P48298 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl11P48298 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl11P48298 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl11P48298 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl11P48298 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl11P48298 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl11P48298 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl11P48298 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl11P48298 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl11P48298 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl11P48298 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl11P48298 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl11P48298 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl11P48298 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl11P48298 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl11P48298 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl11P48298 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl11P48298 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl11P48298 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl11P48298 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl11P48298 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl11P48298 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl11P48298 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl11P48298 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl11P48298 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl11P48298 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl11P48298 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl11P48298 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl11P48298 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl11P48298 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl11P48298 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl11P48298 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl11P48298 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl11P48298 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl11P48298 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl11P48298 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl11P48298 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl11P48298 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl11P48298 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl11P48298 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl11P48298 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl11P48298 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl11P48298 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl11P48298 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl11P48298 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl11P48298 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl11P48298 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl11P48298 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl11P48298 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl11P48298 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl11P48298 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl11P48298 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Ccl11P48298 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.71
Ccl11P48298 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl11P48298 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl11P48298 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl11P48298 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl11P48298 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl11P48298 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl11P48298 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl11P48298 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl11P48298 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl11P48298 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl11P48298 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl11P48298 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl11P48298 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl11P48298 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl11P48298 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl11P48298 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl11P48298 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl11P48298 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccl11P48298 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms