Protein–RNA interactions for Protein: P47242

Pax9, Paired box protein Pax-9, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax9P47242 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pax9P47242 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pax9P47242 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pax9P47242 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pax9P47242 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pax9P47242 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pax9P47242 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pax9P47242 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pax9P47242 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Pax9P47242 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pax9P47242 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pax9P47242 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pax9P47242 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pax9P47242 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pax9P47242 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pax9P47242 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pax9P47242 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pax9P47242 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pax9P47242 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pax9P47242 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pax9P47242 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pax9P47242 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pax9P47242 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pax9P47242 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pax9P47242 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pax9P47242 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pax9P47242 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pax9P47242 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pax9P47242 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pax9P47242 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pax9P47242 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Pax9P47242 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pax9P47242 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pax9P47242 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pax9P47242 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pax9P47242 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pax9P47242 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Pax9P47242 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pax9P47242 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pax9P47242 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pax9P47242 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pax9P47242 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pax9P47242 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pax9P47242 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pax9P47242 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pax9P47242 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pax9P47242 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pax9P47242 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pax9P47242 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pax9P47242 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pax9P47242 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pax9P47242 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pax9P47242 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pax9P47242 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pax9P47242 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pax9P47242 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pax9P47242 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pax9P47242 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pax9P47242 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pax9P47242 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pax9P47242 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pax9P47242 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pax9P47242 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pax9P47242 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pax9P47242 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pax9P47242 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pax9P47242 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pax9P47242 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pax9P47242 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pax9P47242 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pax9P47242 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pax9P47242 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pax9P47242 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pax9P47242 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pax9P47242 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pax9P47242 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pax9P47242 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pax9P47242 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pax9P47242 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pax9P47242 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pax9P47242 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pax9P47242 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pax9P47242 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pax9P47242 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pax9P47242 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Pax9P47242 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pax9P47242 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pax9P47242 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Pax9P47242 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pax9P47242 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pax9P47242 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Pax9P47242 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pax9P47242 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pax9P47242 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pax9P47242 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pax9P47242 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pax9P47242 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pax9P47242 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pax9P47242 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pax9P47242 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms