Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdkn1bP46414 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdkn1bP46414 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdkn1bP46414 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdkn1bP46414 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdkn1bP46414 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdkn1bP46414 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdkn1bP46414 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdkn1bP46414 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdkn1bP46414 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdkn1bP46414 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdkn1bP46414 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdkn1bP46414 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdkn1bP46414 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdkn1bP46414 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdkn1bP46414 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdkn1bP46414 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdkn1bP46414 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdkn1bP46414 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdkn1bP46414 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdkn1bP46414 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn1bP46414 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn1bP46414 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn1bP46414 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn1bP46414 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn1bP46414 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn1bP46414 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn1bP46414 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn1bP46414 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn1bP46414 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn1bP46414 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn1bP46414 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn1bP46414 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn1bP46414 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn1bP46414 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn1bP46414 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn1bP46414 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn1bP46414 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn1bP46414 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn1bP46414 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn1bP46414 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn1bP46414 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn1bP46414 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn1bP46414 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn1bP46414 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn1bP46414 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn1bP46414 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn1bP46414 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn1bP46414 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn1bP46414 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn1bP46414 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn1bP46414 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn1bP46414 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn1bP46414 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn1bP46414 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn1bP46414 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn1bP46414 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn1bP46414 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn1bP46414 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn1bP46414 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn1bP46414 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn1bP46414 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn1bP46414 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn1bP46414 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn1bP46414 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn1bP46414 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn1bP46414 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn1bP46414 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn1bP46414 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn1bP46414 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn1bP46414 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn1bP46414 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn1bP46414 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn1bP46414 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn1bP46414 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn1bP46414 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn1bP46414 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn1bP46414 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn1bP46414 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn1bP46414 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkn1bP46414 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkn1bP46414 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkn1bP46414 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkn1bP46414 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkn1bP46414 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkn1bP46414 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkn1bP46414 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkn1bP46414 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkn1bP46414 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkn1bP46414 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkn1bP46414 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkn1bP46414 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkn1bP46414 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkn1bP46414 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkn1bP46414 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkn1bP46414 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkn1bP46414 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkn1bP46414 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkn1bP46414 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cdkn1bP46414 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.6 ms