Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rab20P35295 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rab20P35295 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rab20P35295 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rab20P35295 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rab20P35295 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rab20P35295 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rab20P35295 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rab20P35295 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rab20P35295 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rab20P35295 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rab20P35295 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rab20P35295 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rab20P35295 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rab20P35295 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rab20P35295 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
Rab20P35295 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rab20P35295 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rab20P35295 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rab20P35295 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rab20P35295 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rab20P35295 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rab20P35295 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Rab20P35295 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rab20P35295 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rab20P35295 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rab20P35295 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rab20P35295 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rab20P35295 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rab20P35295 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rab20P35295 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rab20P35295 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rab20P35295 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rab20P35295 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rab20P35295 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rab20P35295 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rab20P35295 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rab20P35295 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Rab20P35295 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rab20P35295 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Rab20P35295 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rab20P35295 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Rab20P35295 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rab20P35295 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rab20P35295 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rab20P35295 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Rab20P35295 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rab20P35295 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rab20P35295 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rab20P35295 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rab20P35295 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rab20P35295 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab20P35295 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab20P35295 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab20P35295 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab20P35295 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab20P35295 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab20P35295 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab20P35295 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab20P35295 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab20P35295 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab20P35295 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab20P35295 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab20P35295 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab20P35295 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab20P35295 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab20P35295 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab20P35295 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab20P35295 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab20P35295 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab20P35295 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab20P35295 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab20P35295 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab20P35295 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab20P35295 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab20P35295 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab20P35295 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab20P35295 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab20P35295 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab20P35295 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab20P35295 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab20P35295 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab20P35295 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab20P35295 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab20P35295 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab20P35295 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab20P35295 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab20P35295 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab20P35295 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab20P35295 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab20P35295 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab20P35295 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab20P35295 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab20P35295 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab20P35295 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab20P35295 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab20P35295 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab20P35295 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab20P35295 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab20P35295 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.1 ms