Protein–RNA interactions for Protein: P28033

Cebpb, CCAAT/enhancer-binding protein beta, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CebpbP28033 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
CebpbP28033 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
CebpbP28033 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
CebpbP28033 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
CebpbP28033 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CebpbP28033 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CebpbP28033 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CebpbP28033 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CebpbP28033 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CebpbP28033 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CebpbP28033 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CebpbP28033 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CebpbP28033 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CebpbP28033 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CebpbP28033 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CebpbP28033 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CebpbP28033 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CebpbP28033 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CebpbP28033 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CebpbP28033 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CebpbP28033 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CebpbP28033 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CebpbP28033 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CebpbP28033 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CebpbP28033 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CebpbP28033 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CebpbP28033 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CebpbP28033 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CebpbP28033 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CebpbP28033 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CebpbP28033 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CebpbP28033 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CebpbP28033 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CebpbP28033 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CebpbP28033 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CebpbP28033 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CebpbP28033 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CebpbP28033 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CebpbP28033 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CebpbP28033 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CebpbP28033 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CebpbP28033 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CebpbP28033 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CebpbP28033 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CebpbP28033 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CebpbP28033 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CebpbP28033 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CebpbP28033 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CebpbP28033 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CebpbP28033 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
CebpbP28033 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CebpbP28033 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CebpbP28033 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CebpbP28033 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CebpbP28033 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CebpbP28033 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CebpbP28033 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CebpbP28033 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CebpbP28033 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CebpbP28033 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CebpbP28033 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CebpbP28033 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CebpbP28033 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CebpbP28033 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CebpbP28033 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CebpbP28033 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CebpbP28033 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
CebpbP28033 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CebpbP28033 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CebpbP28033 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CebpbP28033 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
CebpbP28033 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CebpbP28033 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
CebpbP28033 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CebpbP28033 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CebpbP28033 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CebpbP28033 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CebpbP28033 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CebpbP28033 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CebpbP28033 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CebpbP28033 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
CebpbP28033 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CebpbP28033 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
CebpbP28033 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CebpbP28033 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CebpbP28033 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CebpbP28033 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CebpbP28033 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CebpbP28033 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CebpbP28033 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CebpbP28033 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CebpbP28033 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CebpbP28033 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CebpbP28033 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CebpbP28033 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CebpbP28033 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CebpbP28033 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CebpbP28033 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CebpbP28033 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CebpbP28033 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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