Protein–RNA interactions for Protein: P25801

Lmo2, Rhombotin-2, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo2P25801 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Lmo2P25801 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lmo2P25801 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Lmo2P25801 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Lmo2P25801 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lmo2P25801 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lmo2P25801 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lmo2P25801 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Lmo2P25801 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lmo2P25801 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lmo2P25801 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Lmo2P25801 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Lmo2P25801 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lmo2P25801 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lmo2P25801 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lmo2P25801 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms