Protein–RNA interactions for Protein: P21841

Sftpc, Pulmonary surfactant-associated protein C, mousemouse

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Length 193 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpcP21841 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SftpcP21841 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SftpcP21841 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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SftpcP21841 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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SftpcP21841 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
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SftpcP21841 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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SftpcP21841 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
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SftpcP21841 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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SftpcP21841 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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SftpcP21841 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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SftpcP21841 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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SftpcP21841 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SftpcP21841 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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