Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ms4a2P20490 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ms4a2P20490 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ms4a2P20490 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ms4a2P20490 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ms4a2P20490 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ms4a2P20490 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ms4a2P20490 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ms4a2P20490 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ms4a2P20490 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ms4a2P20490 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ms4a2P20490 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ms4a2P20490 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ms4a2P20490 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ms4a2P20490 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ms4a2P20490 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ms4a2P20490 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ms4a2P20490 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ms4a2P20490 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ms4a2P20490 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ms4a2P20490 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ms4a2P20490 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ms4a2P20490 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ms4a2P20490 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ms4a2P20490 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ms4a2P20490 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ms4a2P20490 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ms4a2P20490 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ms4a2P20490 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ms4a2P20490 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ms4a2P20490 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ms4a2P20490 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ms4a2P20490 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ms4a2P20490 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ms4a2P20490 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ms4a2P20490 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ms4a2P20490 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ms4a2P20490 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ms4a2P20490 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ms4a2P20490 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ms4a2P20490 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ms4a2P20490 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ms4a2P20490 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ms4a2P20490 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ms4a2P20490 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ms4a2P20490 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ms4a2P20490 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ms4a2P20490 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ms4a2P20490 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ms4a2P20490 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ms4a2P20490 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ms4a2P20490 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ms4a2P20490 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ms4a2P20490 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ms4a2P20490 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ms4a2P20490 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ms4a2P20490 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ms4a2P20490 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ms4a2P20490 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ms4a2P20490 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ms4a2P20490 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ms4a2P20490 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ms4a2P20490 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ms4a2P20490 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ms4a2P20490 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ms4a2P20490 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ms4a2P20490 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ms4a2P20490 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ms4a2P20490 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ms4a2P20490 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ms4a2P20490 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ms4a2P20490 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ms4a2P20490 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ms4a2P20490 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ms4a2P20490 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ms4a2P20490 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ms4a2P20490 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ms4a2P20490 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ms4a2P20490 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ms4a2P20490 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ms4a2P20490 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ms4a2P20490 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ms4a2P20490 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ms4a2P20490 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ms4a2P20490 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ms4a2P20490 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ms4a2P20490 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ms4a2P20490 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ms4a2P20490 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ms4a2P20490 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ms4a2P20490 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ms4a2P20490 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ms4a2P20490 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ms4a2P20490 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ms4a2P20490 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ms4a2P20490 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ms4a2P20490 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ms4a2P20490 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ms4a2P20490 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ms4a2P20490 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms