Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

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Length 1,090 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NefhP19246 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NefhP19246 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NefhP19246 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NefhP19246 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
NefhP19246 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NefhP19246 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NefhP19246 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
NefhP19246 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NefhP19246 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NefhP19246 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
NefhP19246 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NefhP19246 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NefhP19246 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NefhP19246 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NefhP19246 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NefhP19246 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NefhP19246 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NefhP19246 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NefhP19246 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NefhP19246 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NefhP19246 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NefhP19246 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NefhP19246 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NefhP19246 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NefhP19246 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NefhP19246 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NefhP19246 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
NefhP19246 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NefhP19246 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NefhP19246 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NefhP19246 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NefhP19246 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NefhP19246 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NefhP19246 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NefhP19246 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NefhP19246 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
NefhP19246 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
NefhP19246 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NefhP19246 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NefhP19246 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
NefhP19246 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NefhP19246 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NefhP19246 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NefhP19246 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NefhP19246 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NefhP19246 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NefhP19246 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NefhP19246 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NefhP19246 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
NefhP19246 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NefhP19246 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NefhP19246 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NefhP19246 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
NefhP19246 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NefhP19246 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NefhP19246 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
NefhP19246 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NefhP19246 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
NefhP19246 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NefhP19246 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NefhP19246 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NefhP19246 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NefhP19246 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
NefhP19246 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
NefhP19246 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NefhP19246 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NefhP19246 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NefhP19246 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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NefhP19246 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
NefhP19246 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NefhP19246 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NefhP19246 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NefhP19246 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NefhP19246 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NefhP19246 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NefhP19246 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NefhP19246 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NefhP19246 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NefhP19246 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NefhP19246 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NefhP19246 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NefhP19246 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NefhP19246 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NefhP19246 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NefhP19246 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
NefhP19246 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NefhP19246 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NefhP19246 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NefhP19246 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NefhP19246 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NefhP19246 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NefhP19246 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NefhP19246 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NefhP19246 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NefhP19246 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NefhP19246 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NefhP19246 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NefhP19246 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
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