Protein–RNA interactions for Protein: P12246

Apcs, Serum amyloid P-component, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApcsP12246 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ApcsP12246 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ApcsP12246 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ApcsP12246 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ApcsP12246 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
ApcsP12246 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
ApcsP12246 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ApcsP12246 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ApcsP12246 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
ApcsP12246 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ApcsP12246 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
ApcsP12246 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ApcsP12246 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ApcsP12246 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
ApcsP12246 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
ApcsP12246 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ApcsP12246 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ApcsP12246 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
ApcsP12246 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ApcsP12246 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ApcsP12246 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ApcsP12246 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
ApcsP12246 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ApcsP12246 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ApcsP12246 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ApcsP12246 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
ApcsP12246 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ApcsP12246 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ApcsP12246 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ApcsP12246 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
ApcsP12246 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
ApcsP12246 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
ApcsP12246 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ApcsP12246 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ApcsP12246 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ApcsP12246 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
ApcsP12246 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ApcsP12246 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ApcsP12246 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
ApcsP12246 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ApcsP12246 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ApcsP12246 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ApcsP12246 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
ApcsP12246 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ApcsP12246 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ApcsP12246 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ApcsP12246 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
ApcsP12246 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ApcsP12246 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ApcsP12246 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ApcsP12246 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ApcsP12246 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ApcsP12246 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ApcsP12246 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
ApcsP12246 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ApcsP12246 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
ApcsP12246 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ApcsP12246 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ApcsP12246 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
ApcsP12246 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
ApcsP12246 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
ApcsP12246 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ApcsP12246 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ApcsP12246 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
ApcsP12246 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ApcsP12246 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ApcsP12246 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
ApcsP12246 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ApcsP12246 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
ApcsP12246 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ApcsP12246 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ApcsP12246 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
ApcsP12246 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ApcsP12246 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
ApcsP12246 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
ApcsP12246 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ApcsP12246 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ApcsP12246 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
ApcsP12246 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ApcsP12246 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ApcsP12246 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ApcsP12246 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
ApcsP12246 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
ApcsP12246 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
ApcsP12246 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
ApcsP12246 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
ApcsP12246 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
ApcsP12246 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
ApcsP12246 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
ApcsP12246 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
ApcsP12246 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
ApcsP12246 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
ApcsP12246 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
ApcsP12246 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
ApcsP12246 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
ApcsP12246 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
ApcsP12246 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
ApcsP12246 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
ApcsP12246 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
ApcsP12246 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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