Protein–RNA interactions for Protein: P0C5E4

Ptprq, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, mousemouse

Predictions only

Length 2,300 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprqP0C5E4 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 1700099I09Rik-201ENSMUST00000167834 769 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
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PtprqP0C5E4 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Zzef1-207ENSMUST00000172220 11249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
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PtprqP0C5E4 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
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PtprqP0C5E4 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
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PtprqP0C5E4 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Bmpr2-201ENSMUST00000087435 12899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PtprqP0C5E4 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PtprqP0C5E4 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
PtprqP0C5E4 Gm7541-201ENSMUST00000118361 535 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
PtprqP0C5E4 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
PtprqP0C5E4 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
PtprqP0C5E4 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
PtprqP0C5E4 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
PtprqP0C5E4 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
PtprqP0C5E4 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
PtprqP0C5E4 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
PtprqP0C5E4 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
PtprqP0C5E4 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
PtprqP0C5E4 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
PtprqP0C5E4 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
PtprqP0C5E4 Arhgef33-207ENSMUST00000224966 490 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
PtprqP0C5E4 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
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