Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Spta1P08032 1700001C02Rik-202ENSMUST00000114743 729 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Spta1P08032 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Spta1P08032 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Gm25604-201ENSMUST00000158359 133 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Spta1P08032 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Spta1P08032 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Spta1P08032 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Mir181d-201ENSMUST00000102383 72 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Spta1P08032 AC140375.1-201ENSMUST00000225421 694 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Spta1P08032 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
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