Protein–RNA interactions for Protein: P05555

Itgam, Integrin alpha-M, mousemouse

Predictions only

Length 1,153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgamP05555 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ItgamP05555 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ItgamP05555 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ItgamP05555 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ItgamP05555 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ItgamP05555 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ItgamP05555 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ItgamP05555 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ItgamP05555 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ItgamP05555 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ItgamP05555 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ItgamP05555 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ItgamP05555 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ItgamP05555 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ItgamP05555 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ItgamP05555 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ItgamP05555 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ItgamP05555 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ItgamP05555 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ItgamP05555 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ItgamP05555 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ItgamP05555 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ItgamP05555 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ItgamP05555 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ItgamP05555 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ItgamP05555 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ItgamP05555 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ItgamP05555 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ItgamP05555 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ItgamP05555 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ItgamP05555 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ItgamP05555 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ItgamP05555 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ItgamP05555 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ItgamP05555 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ItgamP05555 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ItgamP05555 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ItgamP05555 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ItgamP05555 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ItgamP05555 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ItgamP05555 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ItgamP05555 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ItgamP05555 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ItgamP05555 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
ItgamP05555 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ItgamP05555 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ItgamP05555 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ItgamP05555 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ItgamP05555 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ItgamP05555 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ItgamP05555 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ItgamP05555 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ItgamP05555 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ItgamP05555 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ItgamP05555 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
ItgamP05555 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ItgamP05555 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ItgamP05555 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ItgamP05555 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ItgamP05555 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ItgamP05555 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ItgamP05555 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ItgamP05555 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ItgamP05555 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
ItgamP05555 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
ItgamP05555 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
ItgamP05555 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ItgamP05555 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ItgamP05555 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ItgamP05555 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ItgamP05555 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ItgamP05555 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ItgamP05555 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ItgamP05555 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ItgamP05555 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ItgamP05555 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ItgamP05555 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ItgamP05555 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ItgamP05555 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ItgamP05555 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ItgamP05555 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ItgamP05555 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ItgamP05555 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ItgamP05555 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ItgamP05555 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ItgamP05555 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ItgamP05555 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ItgamP05555 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ItgamP05555 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ItgamP05555 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ItgamP05555 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
ItgamP05555 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ItgamP05555 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
ItgamP05555 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
ItgamP05555 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
ItgamP05555 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
ItgamP05555 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
ItgamP05555 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
ItgamP05555 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ItgamP05555 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 208.3 ms